RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TRIB2	Q92519	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	STAM	Q92783	540 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	AK8	Q96MA6	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	NFASC	O94856	1347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934		E9PMD0	336 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934		H3BNC9	293 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934		H7C1Q1	480 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	STBD1	O95210	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GGPS1	O95749	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RPA1	P27694	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	AGTR2	P50052	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PRKAA2	P54646	552 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ACTR2	P61160	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TFF2	Q03403	129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CUL4B	Q13620	913 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	NEDD9	Q14511	834 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KCNB1	Q14721	858 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DHX58	Q96C10	678 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RITA1	Q96K30	269 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PCYT2	Q99447	389 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	LCT	P09848	1927 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms