RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 RHPN2P1A8MT19 583 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PPM1DO15297 605 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DAB1O75553 588 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 POP4O95707 220 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 GSRP00390 522 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 FUCA1P04066 466 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ERBB2P04626 1255 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 GLI1P08151 1106 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ABHD18Q0P651 414 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ERV3-1Q14264 604 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PASD1Q8IV76 773 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 HAPLN3Q96S86 360 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 NPY6RQ99463 290 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 WDCPQ9H6R7 721 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ASNSD1Q9NWL6 643 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DONSONQ9NYP3 566 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 HPSEQ9Y251 543 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 KCTD3Q9Y597 815 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 A8MU76 341 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 STK17BO94768 372 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PIGNO95427 931 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MYL1P05976 194 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 KRT5P13647 590 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 AK4P27144 223 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 STAT5AP42229 794 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 KIAA1024LP59773 190 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 EFHC1Q5JVL4 640 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 LRRC31Q6UY01 552 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ZNF783Q6ZMS7 281 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 KDELC2Q7Z4H8 507 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PRR7Q8TB68 274 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 KCND3Q9UK17 655 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 HIVEP1P15822 2718 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 THAP12O43422 761 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DLGAP3O95886 979 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 GM2AP17900 193 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 LIG3P49916 1009 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 RAB15P59190 212 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MC2RQ01718 297 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MC1RQ01726 317 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MTM1Q13496 603 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SNAP47Q5SQN1 464 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 NAGSQ8N159 534 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 HMCESQ96FZ2 354 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 C1orf74Q96LT6 269 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TBCBQ99426 244 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 EFHD1Q9BUP0 239 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 LUZP4Q9P127 313 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 TAAR2Q9P1P5 351 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MOSPD1Q9UJG1 213 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CROCCQ5TZA2 2017 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 FAM170AA1A519 330 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 RFPL1O75677 317 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 CCNB1P14635 433 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ZNF28P17035 718 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PRCPP42785 496 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SULT1E1P49888 294 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 GCNT1Q02742 428 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MTA1Q13330 715 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 SQSTM1Q13501 440 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 AGERQ15109 404 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 MEA1Q16626 185 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 RAB6CQ53S08 254 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ATL2Q8NHH9 583 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 KIAA1524Q8TCG1 905 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 NT5C3BQ969T7 300 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 RAB6CQ9H0N0 254 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PDP2Q9P2J9 529 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 DKK3Q9UBP4 350 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-230ENST00000551968 PRSS38A1L453 326 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms