RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 VSNL1P62760 191 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 ARHGEF7Q14155 803 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 CASC4Q6P4E1 433 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 CROCCP2Q86T23 111 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 PALM2Q8IXS6 379 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.36□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.36□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 CAVIN3Q969G5 261 aa9.36□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 KIFC1Q9BW19 673 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 OCEL1Q9H607 264 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 PPCSQ9HAB8 311 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 PKP3Q9Y446 797 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 V9GYY5 206 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 PFDN6O15212 129 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 USP1O94782 785 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 PIGNO95427 931 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 APBB3O95704 486 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 PYGLP06737 847 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 CTSLP07711 333 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 ADRB3P13945 408 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 ECHS1P30084 290 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 VIPR1P32241 457 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 NUDT1P36639 197 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 CXCL12P48061 93 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 CD320Q9NPF0 282 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 SOX13Q9UN79 622 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 M0R296 226 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-220ENST00000550700 USP12O75317 370 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-220ENST00000550700 IGLV3-19P01714 112 aa9.34□□□□□ -0.91
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