RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 IHHQ14623 411 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TBCCQ15814 346 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR158Q5T848 1215 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 HTR3DQ70Z44 454 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 OXSMQ9NWU1 459 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 LEFTY2O00292 366 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GLDCP23378 1020 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 BBS5Q8N3I7 341 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 IFT43Q96FT9 208 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SCYL1Q96KG9 808 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 EBF4Q9BQW3 602 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PNPOQ9NVS9 261 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 MROH6A6NGR9 719 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPN14A8MX76 684 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TBL1XO60907 577 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ARRB2P32121 409 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKAA2P54646 552 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC12A2P55011 1212 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 POU4F1Q01851 419 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 FSCBQ5H9T9 825 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GPATCH11Q8N954 259 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GYG2O15488 501 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 WFS1O76024 890 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPA4LO95757 839 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 EPOP01588 193 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMB3Q13751 1172 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 IL31Q6EBC2 164 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP97Q8IW35 865 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 FEM1CQ96JP0 617 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.858e-7■■■□□ 16.4
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A087X1B8 175 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ILVBLA1L0T0 632 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC7A4O43246 635 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOCP08134 193 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PFKLP17858 780 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-DPA1P20036 260 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 MIPEPQ99797 713 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TK2O00142 265 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 MUSKO15146 869 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF1P05230 155 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CCND1P24385 295 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 LIPMQ5VYY2 423 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 GALNT7Q86SF2 657 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM13CQ8NE31 585 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 STYXQ8WUJ0 223 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 BHMTQ93088 406 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT3Q9UH03 358 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 SZT2Q5T011 3432 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-211ENST00000539589 XYLBO75191 536 aa20.34■□□□□ 0.85
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