RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 DOLKQ9UPQ8 538 aa23.34■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 A0A1W2PQM1 296 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 LIPCP11150 499 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 RHOQP17081 205 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 TGIF1Q15583 401 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 JAMLQ86YT9 394 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 C3orf20Q8ND61 904 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 CXorf40AQ8TE69 158 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM74Q96NL1 305 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 FOXP3Q9BZS1 431 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 DEF6Q9H4E7 631 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM248Q9NWD8 314 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 OR12D3Q9UGF7 316 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 NENFQ9UMX5 172 aa23.33■■□□□ 1.33
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ITGB6P18564 788 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 CCL7P80098 99 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 IRF4Q15306 451 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ALG11Q2TAA5 492 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC73Q5JTD7 316 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 EXTL1Q92935 676 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 DKK3Q9UBP4 350 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 HPCAL4Q9UM19 191 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 NEU3Q9UQ49 428 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SDK2Q58EX2 2172 aa23.32■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 A0A087X0T9 212 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 RASGRP1O95267 797 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 FAM228BP0C875 321 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 CTSEP14091 401 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 HGFP14210 728 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 C2CD6Q53TS8 623 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 HID1Q8IV36 788 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SEMA3CQ99985 751 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM4Q9C037 500 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 LRRN3Q9H3W5 708 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 DNAI1Q9UI46 699 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 GPR34Q9UPC5 381 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa23.31■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 AKR1B10O60218 316 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 TIMP2P16035 220 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ADRA1BP35368 520 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SUOXP51687 545 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 RAD51Q06609 339 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 NFATC4Q14934 902 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM52BQ4KMG9 183 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ATG14Q6ZNE5 492 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 GKN2Q86XP6 184 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 CHP1Q99653 195 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 PARVAQ9NVD7 372 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 WDR70Q9NW82 654 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 PISDQ9UG56 409 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 NBASA2RRP1 2371 aa23.3■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SIGLEC16A6NMB1 481 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 KDELR3O43731 214 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 RAMP2O60895 175 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 TMCC1O94876 653 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 LCA5LO95447 670 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 JMJD7P0C870 316 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SFTPCP11686 197 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ITIH2P19823 946 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ATP11AP98196 1134 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC14Q15048 493 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 WSCD2Q2TBF2 565 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 GPR156Q8NFN8 814 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM159Q96B96 161 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 APPL1Q9UKG1 709 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 INTUQ9ULD6 942 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 LOXL2Q9Y4K0 774 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SCINQ9Y6U3 715 aa23.29■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.28■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD62A6NC57 917 aa23.28■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 FAM72CH0Y354 149 aa23.28■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 SUV39H1O43463 412 aa23.28■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 LRIG2O94898 1065 aa23.28■■□□□ 1.32
SIMC1-208ENST00000495423 IGSF6O95976 241 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms