RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 RANBP9Q96S59 729 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 KIFC1Q9BW19 673 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 HACD3Q9P035 362 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 DKK3Q9UBP4 350 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 C2orf81A6NN90 581 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CHRNB1P11230 501 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 HNF1BP35680 557 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 GPX6P59796 221 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 UGP2Q16851 508 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 MFSD3Q96ES6 412 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ARL5AQ9Y689 179 aa22.13■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 FAM170BA6NMN3 283 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 A8MX80 341 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SPAG6O75602 509 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 USP1O94782 785 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TSHRP16473 764 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 NMBRP28336 390 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 FAM193AP78312 1265 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SATB1Q01826 763 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CACUL1Q86Y37 369 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 OR2T3Q8NH03 318 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SCRN2Q96FV2 425 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF778Q96MU6 729 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 NELL2Q99435 816 aa22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 GSTA2P09210 222 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ITGB7P26010 798 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 METAP1P53582 386 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CRYMQ14894 314 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM135Q86UB9 458 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TRABDQ9H4I3 376 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 FBRSQ9HAH7 460 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CD320Q9NPF0 282 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 PLAAQ9Y263 795 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF711Q9Y462 761 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CAPN8A6NHC0 703 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 AURKAO14965 403 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TIMP2P16035 220 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 PAMP19021 973 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 PDE1BQ01064 536 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SEMG2Q02383 582 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CST6Q15828 149 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ARMC3Q5W041 872 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 FBF1Q8TES7 1133 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SPOCK2Q92563 424 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ARRDC3Q96B67 414 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 FOXQ1Q9C009 403 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 KCTD3Q9Y597 815 aa22.11■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 A0A0U1RQS6 177 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PQF6 199 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TSPAN11A1L157 253 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 LDB2O43679 373 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ADH1BP00325 375 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 STX2P32856 288 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 STEAP4Q687X5 459 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 Q6ZS52 159 aa22.1■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.1■■□□□ 1.13
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