RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 GDI1P31150 447 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ABL2P42684 1182 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ST8SIA6P61647 398 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ACVR1Q04771 509 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 OR6P1Q8NGX9 317 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PIH1D2Q8WWB5 315 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 HDAC10Q969S8 669 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 RBBP8Q99708 897 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 GTSE1Q9NYZ3 720 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 CD207Q9UJ71 328 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PLA2G4CQ9UP65 541 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 FAM47DPA6NHR8 397 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA8RI6L899 631 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 BUD23O43709 281 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SIN3BO75182 1162 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ITGA2BP08514 1039 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 KDSRQ06136 332 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 UGP2Q16851 508 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD42Q8N9B4 389 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 MDGA1Q8NFP4 955 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TTC8Q8TAM2 541 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 DENND4AQ7Z401 1863 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TTC34A8MYJ7 566 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TIMM44O43615 452 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PYGBP11216 843 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 GNGT1P63211 74 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PDE1BQ01064 536 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF470Q6ECI4 717 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TIFABQ6ZNK6 161 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 OR2A12Q8NGT7 310 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 FRS2Q8WU20 508 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SMIM14Q96QK8 99 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PSD3Q9NYI0 1048 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 GGT7Q9UJ14 662 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 AURKAO14965 403 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 RPP40O75818 363 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 LPOP22079 712 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 GJA4P35212 333 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ARSDP51689 593 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 LIMK2P53671 638 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TMPRSS15P98073 1019 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 MESP2Q0VG99 397 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 MPP2Q14168 576 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PTPRNQ16849 979 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 OR13C4Q8NGS5 318 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 FAM161BQ96MY7 647 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 MFSD1Q9H3U5 465 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SUV39H2Q9H5I1 410 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 MAGEE1Q9HCI5 957 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PRRT4C9JH25 899 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 RFPL1O75677 317 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SLC18A1P54219 525 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 DENND6AQ8IWF6 608 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 OTUD6BQ8N6M0 293 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SUSD6Q92537 303 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 NXPE3Q969Y0 559 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TBATAQ96M53 351 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 WASH3PC4AMC7 463 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 CCL22O00626 93 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TYROBPO43914 113 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SLC4A1P02730 911 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 CTPS1P17812 591 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SLC18A2Q05940 514 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 CTBP1Q13363 440 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PTPRCAPQ14761 206 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TERF2Q15554 542 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0408Q6ZU52 694 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 LMNTD2Q8IXW0 634 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 BANPQ8N9N5 519 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 TERB1Q8NA31 727 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 MGARPQ8TDB4 240 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 CENPTQ96BT3 561 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO5Q9UKT4 447 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-210ENST00000489475 BRWD1Q9NSI6 2320 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 OPRD1P41143 372 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 SLC1A2P43004 574 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 SH2D5Q6ZV89 423 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms