RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 MPOP05164 745 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 LIMK2P53671 638 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 USP10Q14694 798 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 UNC93AQ86WB7 457 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CADM3Q8N126 398 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OR2T34Q8NGX1 318 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OR2T3Q8NH03 318 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 GLT1D1Q96MS3 346 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SNX25Q9H3E2 840 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 EHD1Q9H4M9 534 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SIAEQ9HAT2 523 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RIC8BQ9NVN3 520 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MID2Q9UJV3 735 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 POU2F3Q9UKI9 436 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FZD10Q9ULW2 581 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SLCO1B7G3V0H7 640 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FAM72CH0Y354 149 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RNF103O00237 685 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 EI24O14681 340 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 BMP2P12643 396 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FASP25445 335 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 LRPAP1P30533 357 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 GSSP48637 474 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CCNA1P78396 465 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FAM72AQ5TYM5 149 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FAM72DQ6L9T8 149 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ERMP1Q7Z2K6 904 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PID1Q7Z2X4 250 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IFNEQ86WN2 208 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FAM72BQ86X60 149 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ANKFN1Q8N957 763 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 BRI3BPQ8WY22 251 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 P2RY11Q96G91 374 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZFP42Q96MM3 310 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NAT9Q9BTE0 207 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ADNPQ9H2P0 1102 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RAD21L1Q9H4I0 556 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PALMDQ9NP74 551 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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NISCH-212ENST00000488380 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.54□□□□□ -0.24
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NISCH-212ENST00000488380 PFDN6O15212 129 aa13.54□□□□□ -0.24
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NISCH-212ENST00000488380 MT-ND1P03886 318 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OPRL1P41146 370 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MAPK11Q15759 364 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CCL15Q16663 113 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0319Q5VV43 1072 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CRYBG2Q8N1P7 616 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
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NISCH-212ENST00000488380 NRBF2Q96F24 287 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SPATA13Q96N96 652 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 APOL2Q9BQE5 337 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TINF2Q9BSI4 451 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ING2Q9H160 280 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DERAQ9Y315 318 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 V9GYQ6 96 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DHRS12A0PJE2 317 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MYO1DO94832 1006 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MATKP42679 507 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MLLT10P55197 1068 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TPTEP56180 551 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NAB1Q13506 487 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 20
NISCH-212ENST00000488380 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IL31Q6EBC2 164 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PAQR9Q6ZVX9 377 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FRA10AC1Q70Z53 315 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 APPL2Q8NEU8 664 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OLFM1Q99784 485 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PIGVQ9NUD9 493 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
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