RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621		X6R8D5	127 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621		A0A0B4J269	797 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621		K7EM74	188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	GABRD	O14764	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TPP1	O14773	563 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TLR5	O60602	858 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	HIP1R	O75146	1068 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TBX18	O95935	607 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	GOT1	P17174	413 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CAPN3	P20807	821 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	MUT	P22033	750 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CCKBR	P32239	447 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	SLC8A1	P32418	973 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	PTGER4	P35408	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	LIG4	P49917	911 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	MC1R	Q01726	317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CDC20	Q12834	499 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CST6	Q15828	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	NTRK3	Q16288	839 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621		H0YCG3	227 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	AGRP	O00253	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	AQP9	O43315	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	HCRT	O43612	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	DEXI	O95424	95 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	C5AR1	P21730	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	LMO2	P25791	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ITGA3	P26006	1051 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CDC25A	P30304	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CSF2RB	P32927	897 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ETV5	P41161	510 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ADPRH	P54922	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	NPY5R	Q15761	445 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC4-204	ENST00000486621	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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