RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00303Q3SY05 128 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ARTNQ5T4W7 220 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 USP53Q70EK8 1073 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXO39Q8N4B4 442 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM58Q8NG06 486 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ASB12Q8WXK4 309 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 NT5C3BQ969T7 300 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB7BQ96AH8 199 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 CENPTQ96BT3 561 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 SH3GL2Q99962 352 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 IL17BQ9UHF5 180 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-207ENST00000484547 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 GJB6O95452 261 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 CD160O95971 181 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 UGT2B4P06133 528 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 HGFP14210 728 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 UGT1A5P35504 534 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ACVRL1P37023 503 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 PPARDQ03181 441 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC25A52Q3SY17 297 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ALS2CLQ60I27 953 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB11FIP2Q7L804 512 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 KYQ8NBH2 561 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 EXTL1Q92935 676 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 AGRPO00253 132 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 NOBOXO60393 691 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 MMP20O60882 483 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 FLT3P36888 993 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 CCL7P80098 99 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 EMBQ6PCB8 327 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 MACC1Q6ZN28 852 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM131BQ86XD5 332 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ARL10Q8N8L6 244 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDH19Q8TAB3 1148 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 SGF29Q96ES7 293 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 TBATAQ96M53 351 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 HAPLN3Q96S86 360 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 STRADBQ9C0K7 418 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 PISDQ9UG56 409 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 D6RAR5 112 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 AREL1O15033 823 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 TM7SF2O76062 418 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM87AP0C7U9 286 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ITIH2P19823 946 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 PON1P27169 355 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 VAV2P52735 878 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 INHBCP55103 352 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 YPEL5P62699 121 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 UBXN1Q04323 297 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 C2CD6Q53TS8 623 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-207ENST00000484547 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms