RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 PGAM1P18669 254 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 INPP5AQ14642 412 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HMBOX1Q6NT76 420 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF534Q76KX8 674 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PIGZQ86VD9 579 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KCNN1Q92952 543 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 XPR1Q9UBH6 696 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRFP10586 1907 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 RNF103O00237 685 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ARL4AP40617 200 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NR4A2P43354 598 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CLCQ05315 142 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TAZQ16635 292 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NOTUMQ6P988 496 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CADM3Q8N126 398 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 APPL2Q8NEU8 664 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TFAP2CQ92754 450 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MUC3BQ9H195 1237 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 M0QYT0 321 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 XYLBO75191 536 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TADA2AO75478 443 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NCK1P16333 377 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K7CLP57077 242 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 REP15Q6BDI9 236 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DSG4Q86SJ6 1040 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ELMO1Q92556 727 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GLMNQ92990 594 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CITO14578 2027 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HUS1O60921 280 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SNAP29O95721 258 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DGCR6Q14129 220 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 FAM187BQ17R55 369 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ADCK1Q86TW2 530 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TINF2Q9BSI4 451 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC4Q9HBW1 653 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 VTA1Q9NP79 307 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN25C9JDP6 229 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GRID2O43424 1007 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CLPXO76031 633 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2B6P20813 491 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NHSL2Q5HYW2 709 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 VPS39Q96JC1 886 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DTLQ9NZJ0 730 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 G3V2L1 256 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD11O43934 449 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MFN2O95140 757 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CHEK2O96017 543 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PRKAA2P54646 552 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HASPINQ8TF76 798 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 EDEM1Q92611 657 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HDAC11Q96DB2 347 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DHRS1Q96LJ7 313 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CPNE1Q99829 537 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HMG20AQ9NP66 347 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.28■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 WDR90Q96KV7 1748 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DDHD2O94830 711 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PRKCGP05129 697 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 USP41Q3LFD5 358 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GRTP1Q5TC63 336 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 LIPMQ5VYY2 423 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 WSCD1Q658N2 575 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.27■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms