RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474866.1

MRPS25-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S25, human

TSL 3

Gene MRPS25, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS25-206	ENST00000474866	PCDHGA12	O60330	932 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SOCS5	O75159	536 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ELFN1	P0C7U0	828 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	C6	P13671	934 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	IGFALS	P35858	605 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	MMP12	P39900	470 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	LIG3	P49916	1009 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SUOX	P51687	545 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	VAV2	P52735	878 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	THOP1	P52888	689 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	AP1B1	Q10567	949 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	TRAF2	Q12933	501 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	TCEAL1	Q15170	157 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	NPNT	Q6UXI9	565 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	PLD5	Q8N7P1	536 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	LGMN	Q99538	433 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SEMA3C	Q99985	751 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	DESI2	Q9BSY9	194 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ALG6	Q9Y672	507 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ZNF487	B1APH4	448 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	PCCB	P05166	539 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HLA-DQB2	P05538	268 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	KRT10	P13645	584 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CCNB1	P14635	433 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CR2	P20023	1033 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SPINK2	P20155	84 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CCNC	P24863	283 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	NFKBIA	P25963	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	RABIF	P47224	123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	EPHB1	P54762	984 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	DSC2	Q02487	901 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	BNIP3	Q12983	259 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	LRRC14	Q15048	493 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ACOX1	Q15067	660 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	IRF4	Q15306	451 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SHB	Q15464	509 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HS1BP3	Q53T59	392 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	DENND2C	Q68D51	928 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	EID2	Q8N6I1	236 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HAUS1	Q96CS2	278 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HDAC11	Q96DB2	347 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	BMF	Q96LC9	184 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CDC6	Q99741	560 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CEP41	Q9BYV8	373 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	PI4KA	P42356	2102 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	SPTBN2	O15020	2390 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866		A0A1W2PQ67	120 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866		H3BM21	787 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	FFAR2	O15552	330 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CST8	O60676	142 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	CBFA2T3	O75081	653 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
MRPS25-206	ENST00000474866	PGLS	O95336	258 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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