RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 AIM2O14862 343 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 UBDO15205 165 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PMPCBO75439 489 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CRTAMO95727 393 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GLP2RO95838 553 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 POMCP01189 267 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DQB2P05538 268 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SBK3P0C264 359 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 LINGO3P0C6S8 592 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 VCLP18206 1134 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MPSTP25325 297 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PSMA3P25788 255 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 YWHAQP27348 245 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CD52P31358 61 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ARRB2P32121 409 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ETFBP38117 255 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SLC1A2P43004 574 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 BRCC3P46736 316 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TAS2R39P59534 338 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 STX1BP61266 288 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V0D1P61421 351 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PRAMEP78395 509 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TLE2Q04725 743 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CTBP1Q13363 440 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SERINC3Q13530 473 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FLOT2Q14254 428 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GRM2Q14416 872 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 DLG2Q15700 870 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MMEL1Q495T6 779 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 C5orf22Q49AR2 442 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 NXNQ6DKJ4 435 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SNX32Q86XE0 403 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 LSMEM2Q8N112 164 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PELI3Q8N2H9 469 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 USP33Q8TEY7 942 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 DDI1Q8WTU0 396 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 LPPQ93052 612 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ASB9Q96DX5 294 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 IFT43Q96FT9 208 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 OR52B2Q96RD2 323 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CDRT15Q96T59 188 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 APOL2Q9BQE5 337 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TRIM15Q9C019 465 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MAGEH1Q9H213 219 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MUC13Q9H3R2 512 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 HIPK3Q9H422 1215 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 POMKQ9H5K3 350 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 WDR41Q9HAD4 459 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 UBP1Q9NZI7 540 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 THEGQ9P2T0 379 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TBX21Q9UL17 535 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PADI4Q9UM07 663 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQH9 124 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SYCE1LA8MT33 242 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TK2O00142 265 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SDHDO14521 159 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0355O15063 1070 aa8.54□□□□□ -1.04
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