RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463477.5

PTPRD-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 1,697 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-207ENST00000463477 CLEC14AQ86T13 490 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PJA1Q8NG27 643 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ADAM32Q8TC27 787 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FAM3CQ92520 227 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FATE1Q969F0 183 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 IL12RB2Q99665 862 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 KIFC1Q9BW19 673 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CEP41Q9BYV8 373 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 C1orf21Q9H246 121 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 HPS4Q9NQG7 708 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MID2Q9UJV3 735 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 E2F8A0AVK6 867 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 WASH4PA8MWX3 477 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 GYG2O15488 501 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ANXA9O76027 345 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 APOA4P06727 396 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ERVK-10P10266 1014 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 GNAZP19086 355 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 NFKB1P19838 968 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SLC1A6P48664 564 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 RAP1GDS1P52306 607 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PRKAA2P54646 552 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FZD5Q13467 585 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 EML3Q32P44 896 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 AFMIDQ63HM1 303 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DCLK2Q8N568 766 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CLDN23Q96B33 292 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FCRL5Q96RD9 977 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 FOXQ1Q9C009 403 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 EBF3Q9H4W6 596 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SNX15Q9NRS6 342 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 COPG2Q9UBF2 871 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TMEM114B3SHH9 223 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TPBGLP0DKB5 382 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CTHP32929 405 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 HK2P52789 917 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 AQP5P55064 265 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TUBB3Q13509 450 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ARTNQ5T4W7 220 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 HTR3DQ70Z44 454 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 KCNMB4Q86W47 210 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 RDH11Q8TC12 318 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 EDEM1Q92611 657 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 OTUB2Q96DC9 234 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 NACA2Q9H009 215 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-207ENST00000463477 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms