RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 PSTPIP1O43586 416 aa24.08■■□□□ 1.45
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SMKR1-201ENST00000462322 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
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SMKR1-201ENST00000462322 AGERQ15109 404 aa24.08■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 HS1BP3Q53T59 392 aa24.08■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.08■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.08■■□□□ 1.45
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SMKR1-201ENST00000462322 RAI2Q9Y5P3 530 aa24.08■■□□□ 1.45
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SMKR1-201ENST00000462322 KLF15Q9UIH9 416 aa24.07■■□□□ 1.44
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SMKR1-201ENST00000462322 SIGLEC6O43699 453 aa24.06■■□□□ 1.44
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SMKR1-201ENST00000462322 HLA-DQB2P05538 268 aa24.06■■□□□ 1.44
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SMKR1-201ENST00000462322 NPNTQ6UXI9 565 aa24.06■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.06■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 MACC1Q6ZN28 852 aa24.06■■□□□ 1.44
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SMKR1-201ENST00000462322 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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SMKR1-201ENST00000462322 RFPL3O75679 317 aa24.03■■□□□ 1.44
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SMKR1-201ENST00000462322 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 C1SP09871 688 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 C1QTNF9P0C862 333 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 GIMD1P0DJR0 217 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 CTPS1P17812 591 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 GM2AP17900 193 aa24.03■■□□□ 1.44
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