RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 IGSF8Q969P0 613 aa20.56■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TTC3P53804 2025 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 BRCA2P51587 3418 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 MROH6A6NGR9 719 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ACOT8O14734 319 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 SUPT7LO94864 414 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 S1PR4O95977 384 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 HDCP19113 662 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 OR1G1P47890 313 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TRIM32Q13049 653 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 STX5Q13190 355 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GRM2Q14416 872 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 SQLEQ14534 574 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 SLC14A2Q15849 920 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.55■□□□□ 0.88
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IMP4-208ENST00000460766 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.55■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TRIM38O00635 465 aa20.54■□□□□ 0.88
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IMP4-208ENST00000460766 KCNC1P48547 511 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 FBXL22Q6P050 247 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PGBD5Q8N414 524 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 EXT2Q93063 718 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PKP2Q99959 881 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 RGS18Q9NS28 235 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 MAPRE2Q15555 327 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 Q9H521 79 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PTPRDP23468 1912 aa20.54■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 E7ENX8 843 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TRPA1O75762 1119 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ATP6AP2O75787 350 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 IMPDH1P20839 514 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PMLP29590 882 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 CRHR2Q13324 411 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ARMC3Q5W041 872 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 REP15Q6BDI9 236 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TBATAQ96M53 351 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TRIM4Q9C037 500 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 MRGBPQ9NV56 204 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 LDB2O43679 373 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 DNAJA2O60884 412 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 RAMP2O60895 175 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS4O75173 837 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 SOAT2O75908 522 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 OAZ2O95190 189 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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IMP4-208ENST00000460766 GRIA2P42262 883 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ISCA2Q86U28 154 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 FATE1Q969F0 183 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ASB9Q96DX5 294 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 C8orf48Q96LL4 319 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 GABRQQ9UN88 632 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PATJQ8NI35 1801 aa20.53■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.52■□□□□ 0.88
IMP4-208ENST00000460766 FBP2O00757 339 aa20.52■□□□□ 0.88
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