RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM17Q9Y577 477 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 YEATS2Q9ULM3 1422 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 STRCQ7RTU9 1775 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TNIKQ9UKE5 1360 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1W2PS29 197 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 C9orf118A6NHY6 69 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 BTBD18B2RXH4 712 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 PDLIM1O00151 329 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 DNM1LO00429 736 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 HCRTR2O43614 444 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 PRAMEF10O60809 474 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 MFAP3LO75121 409 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TACC1O75410 805 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 SUN1O94901 812 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 STAMBPO95630 424 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 OLFM2O95897 454 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF20P17024 532 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 IGFBP2P18065 325 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNA5P22460 613 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ADRA1DP25100 572 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 PON1P27169 355 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 GSTM2P28161 218 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 S100A5P33763 92 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CAMPP49913 170 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CCR3P51677 355 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CHN2P52757 468 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 UBASH3AP57075 661 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 STX1BP61266 288 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CYP4A11Q02928 519 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 DMPKQ09013 629 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 DYRK1AQ13627 763 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 RIN1Q13671 783 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TUBB2AQ13885 445 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 INAQ16352 499 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 FUT11Q495W5 492 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 Q4G0T1 1027 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 BOLA3Q53S33 107 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 AADACL2Q6P093 401 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 WDR73Q6P4I2 378 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 C17orf99Q6UX52 265 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 C16orf89Q6UX73 402 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 SYT10Q6XYQ8 523 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 OTOAQ7RTW8 1153 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ADCK1Q86TW2 530 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF169Q8NCN4 708 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 SHCBP1Q8NEM2 672 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 BRSK1Q8TDC3 778 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CLEC4CQ8WTT0 213 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 SNX19Q92543 992 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 MR1Q95460 341 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM136AQ96C01 138 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ARSGQ96EG1 525 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM237Q96Q45 408 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 NUP85Q9BW27 656 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 HRH4Q9H3N8 390 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD28-205ENST00000460278 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms