RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 SH3BP5O60239 455 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 SDC3O75056 442 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 APOC2P02655 101 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 ELFN1P0C7U0 828 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 CD59P13987 128 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 RBL1P28749 1068 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 IGFALSP35858 605 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 NUDT1P36639 197 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 SKOR1P84550 965 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 WASHC5Q12768 1159 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 NOMO1Q15155 1222 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 SKA1Q96BD8 255 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PI4KAP42356 2102 aa20.61■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 FPGTO14772 594 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PCCBP05166 539 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 SDHBP21912 280 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 LHCGRP22888 699 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 EPHB1P54762 984 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 GALNT3Q14435 633 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 ACOX1Q15067 660 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 IRF4Q15306 451 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 TEX44Q53QW1 395 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 LIPIQ6XZB0 460 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 DPPA4Q7L190 304 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 CENPTQ96BT3 561 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 A6NNZ2 444 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 TJP3O95049 919 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PRLP01236 227 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 NFKB1P19838 968 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PTPN7P35236 360 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 HNF1BP35680 557 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 CETN2P41208 172 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 SUOXP51687 545 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 BNIP3Q12983 259 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 SHBQ15464 509 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 CNGA3Q16281 694 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PPM1JQ5JR12 505 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 GLOD4Q9HC38 313 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 AMACRQ9UHK6 382 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.59■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 FZD6O60353 706 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PMPCBO75439 489 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 GM2AP17900 193 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 ZNF567Q8N184 647 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 TEKT5Q96M29 485 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTX4-203ENST00000447419 PIRTP0C851 137 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 RBP3P10745 1247 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 VIPR1P32241 457 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 CCT8P50990 548 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 GSE1Q14687 1217 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 LRRC14Q15048 493 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 RPS6KA1Q15418 735 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 TCEA2Q15560 299 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 USP45Q70EL2 814 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 PID1Q7Z2X4 250 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 PELI3Q8N2H9 469 aa20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PTX4-203ENST00000447419 CD84Q9UIB8 345 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms