RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 NPWQ8N729 165 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G15Q8NCC3 412 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC74AQ96AQ1 378 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 GRAMD1AQ96CP6 724 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PDXPQ96GD0 296 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR92Q96MX6 357 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC46A1Q96NT5 459 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 EDEM3Q9BZQ6 932 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 HAUS4Q9H6D7 363 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 A8MX80 341 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TK2O00142 265 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PDX1P52945 283 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TMPRSS3P57727 454 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 BCL2L1Q07817 233 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 RALGDSQ12967 914 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 MTM1Q13496 603 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SPIDRQ14159 915 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 LVRNQ6Q4G3 990 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PCSK4Q6UW60 755 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ATL2Q8NHH9 583 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR48Q8TAF3 677 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 OR1E3Q8WZA6 343 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF653Q96CK0 615 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 NSMCE3Q96MG7 304 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PHF12Q96QT6 1004 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP69A5D8W1 941 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM202A6NGA9 273 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.757e-22■■■□□ 19.1
SH3BP4-206ENST00000446904 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 LRCH4O75427 683 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF8O76064 485 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFSF15O95150 251 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 MBD3O95983 291 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFP01375 233 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ELFN1P0C7U0 828 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SKILP12757 684 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SCNN1BP51168 640 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 UCNP55089 124 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 AP1S1P61966 158 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CCL7P80098 99 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 IL10RBQ08334 325 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 DPYSQ14117 519 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ACOX1Q15067 660 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 AGERQ15109 404 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 LIPIQ6XZB0 460 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 DPPA4Q7L190 304 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TAF8Q7Z7C8 310 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 GKN2Q86XP6 184 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 ARL14Q8N4G2 192 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 PSKH2Q96QS6 385 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 DPH1Q9BZG8 443 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 FGF22Q9HCT0 170 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 MYO1AQ9UBC5 1043 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 SEPT3Q9UH03 358 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 COL6A6A6NMZ7 2263 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC187A0A096LP49 1063 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 CDRT15L2A8MXV6 281 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 D6RAR5 112 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 GZMAP12544 262 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 TCF4P15884 667 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 GM2AP17900 193 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-206ENST00000446904 AMPD1P23109 780 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms