RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP2P12643 396 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP4P12644 408 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HDCP19113 662 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGP20916 626 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP8P22894 467 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMA2P25787 234 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TYK2P29597 1187 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCND2P30279 289 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NAMPTP43490 491 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HLCSP50747 726 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G16P53816 162 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RX3P56373 397 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BACE1P56817 501 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ANO4Q32M45 955 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TREML2Q5T2D2 321 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGZQ86VD9 579 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ESX1Q8N693 406 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX31Q8N9S9 440 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD6Q8NC69 237 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMC5Q96C12 935 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NRBF2Q96F24 287 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DYRK3O43781 588 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DLGAP3O95886 979 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 APOC2P02655 101 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GARTP22102 1010 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GNG2P59768 71 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MMRN1Q13201 1228 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMC2Q13753 1193 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EML3Q32P44 896 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TBCELQ5QJ74 424 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CASC4Q6P4E1 433 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF773Q6PK81 442 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SGCDQ92629 289 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS33AQ96AX1 596 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PSAT1Q9Y617 370 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EI24O14681 340 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HDAC3O15379 428 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RFPL2O75678 378 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT2B4P06133 528 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 F7P08709 466 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLURP2P0DP57 97 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIA1P42261 906 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 STX1BP61266 288 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CRADDP78560 199 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HERC3Q15034 1050 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DLG2Q15700 870 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PCSK7Q16549 785 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR44Q5JSH3 913 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 XAF1Q6GPH4 301 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 S100ZQ8WXG8 99 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HDAC11Q96DB2 347 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RMDN3Q96TC7 470 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms