RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.67□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX25Q9H3E2 840 aa4.67□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.67□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM49BQ9NUQ9 324 aa4.67□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.67□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.67□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.67□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLXNA2O75051 1894 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUMA1Q14980 2115 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNA1AO00555 2505 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP69A5D8W1 941 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM49BA6NDI0 452 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHISA7A6NL88 538 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPN14A8MX76 684 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 F8VP50 259 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMM2O15305 246 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC43A1O75387 559 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS23O95084 383 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MATN4O95460 622 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SP9P0CG40 484 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KITP10721 976 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF1P10914 325 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDCP19113 662 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD58P19256 250 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 COMTP21964 271 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC6A2P23975 617 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR2F2P24468 414 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEX2P28328 305 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 AVPR1AP37288 418 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBL1P41271 181 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUFMP49411 452 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH8P55286 799 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 STARD6P59095 220 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SATB1Q01826 763 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDSRQ06136 332 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMWDQ09019 674 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTAPQ13126 283 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNB1Q14721 858 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD6Q15008 389 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL31Q6EBC2 164 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM150AQ86TG1 271 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYT12Q8IV01 421 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP28Q8NHY6 868 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRTOMTQ8WZ04 291 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM3CQ92520 227 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIEF2Q96C03 454 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 BDH2Q9BUT1 245 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SDCBP2Q9H190 292 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 EBF3Q9H4W6 596 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD248Q9HCU0 757 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDAP2Q9NXN4 497 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPSEQ9Y251 543 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.66□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DRGXA6NNA5 263 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MXQ7 604 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KINO60870 393 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOL4O94818 638 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 VNN1O95497 513 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 HLA-DRAP01903 254 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSH1P0DML2 217 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSH2P0DML3 217 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYF5P13349 255 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms