RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105		H7C0S8	307 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	STRN	O43815	780 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	DOK2	O60496	412 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	EXOC3	O60645	756 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PDE8B	O95263	885 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SPARC	P09486	303 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	C1S	P09871	688 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PRPH2	P23942	346 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	FPR3	P25089	353 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	NDUFS1	P28331	727 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ABCD1	P33897	745 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	HNF1B	P35680	557 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	VPS41	P49754	854 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CCT8	P50990	548 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MVD	P53602	400 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	LIMK1	P53667	647 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PTP4A2	Q12974	167 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	FZD5	Q13467	585 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TUBA3C	Q13748	450 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SCARB2	Q14108	478 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	BECN1	Q14457	450 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KCNB1	Q14721	858 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	COPS6	Q7L5N1	327 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PXK	Q7Z7A4	578 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TBC1D5	Q92609	795 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	USP6NL	Q92738	828 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ATP2A3	Q93084	1043 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	GSDMA	Q96QA5	445 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	FSD1	Q9BTV5	496 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MXD3	Q9BW11	206 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	YY1AP1	Q9H869	796 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MPP6	Q9NZW5	540 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MAST3	O60307	1309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC69	A6NI79	296 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TEX22	C9J3V5	150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PLOD2	O00469	737 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	DSCR3	O14972	297 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	GCAT	O75600	419 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	TSPAN9	O75954	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	GUCA1C	O95843	209 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MT-ND3	P03897	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	LYL1	P12980	280 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	COX7A2	P14406	83 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	NFKBIA	P25963	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	PCSK6	P29122	969 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	BSG	P35613	385 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	MLH1	P40692	756 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	HNF4A	P41235	474 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CD86	P42081	329 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	STAT6	P42226	847 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	CPA2	P48052	419 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	B4GALNT1	Q00973	533 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	SP3	Q02447	781 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUM2-208	ENST00000432105	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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