RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRKAG1P54619 331 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTPRNQ16849 979 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPR180Q86V85 440 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR4L1Q8NH43 312 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PWWP2AQ96N64 755 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SEMA3CQ99985 751 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 G3V2T6 193 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABLIM1O14639 778 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IDH3BO43837 385 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TBL1XO60907 577 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRHR1P34998 444 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PPM1 405 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IRGMA1A4Y4 181 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSNA1O43805 119 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALOX5P09917 674 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR4A15Q8NGL6 344 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PNPOQ9NVS9 261 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COMMD9Q9P000 198 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MST1RQ04912 1400 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC22A3O75751 556 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGF1P05230 155 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSH1P0DML2 217 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSH2P0DML3 217 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NR2F1P10589 423 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL12AP29459 219 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNMTP50135 292 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POTEHQ6S545 545 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF44Q7L0R7 432 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNS4Q8IZW8 715 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RHBGQ9H310 441 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DERAQ9Y315 318 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UGT2B11O75310 529 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PERM1Q5SV97 790 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINGO1Q96FE5 620 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LGMNQ99538 433 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MECRQ9BV79 373 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSR3Q9UNL2 185 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZACNQ401N2 412 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DENND1CQ8IV53 801 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRMOQ9BU70 441 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSMD11O00231 422 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX28O15482 410 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRKAR1AP10644 381 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACLYP53396 1101 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VGLL4Q14135 290 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMYD1Q8NB12 490 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PANX1Q96RD7 426 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LHX5Q9H2C1 402 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEK6Q9HC98 313 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ING4Q9UNL4 249 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPAN8P19075 237 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDR1Q08345 913 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC20A2Q08357 652 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCNIQ14094 377 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GALNT3Q14435 633 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALG11Q2TAA5 492 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HELQQ8TDG4 1101 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BRD9Q9H8M2 597 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 S100A14Q9HCY8 104 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RFXANKO14593 260 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms