RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412393.5

LINC00342-201, long intergenic non-protein coding RNA 342, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00342, Length 654 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00342-201ENST00000412393 NT5C1BQ96P26 610 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CCT8L2Q96SF2 557 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CHP1Q99653 195 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 SYT3Q9BQG1 590 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 SPHK2Q9NRA0 654 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 OSER1Q9NX31 292 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 HESX1Q9UBX0 185 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 GGT7Q9UJ14 662 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 DMDP11532 3685 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 A0A0U1RQJ8 604 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ANTXRLA6NF34 631 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 KCNJ18B7U540 433 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 NDUFAB1O14561 156 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 PMM2O15305 246 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 P4HA2O15460 535 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 HSF2BPO75031 334 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 LRP3O75074 770 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TULP3O75386 442 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 STC2O76061 302 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 GNA14O95837 355 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 MYBL2P10244 700 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 VDRP11473 427 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 GRIA2P42262 883 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TNFRSF4P43489 277 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TKTL1P51854 596 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 DGKEP52429 567 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 GNGT1P63211 74 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ARHGAP8P85298 464 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CETN1Q12798 172 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 NFATC3Q12968 1075 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 PAK1Q13153 545 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 KCNJ12Q14500 433 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CRY1Q16526 586 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CR1LQ2VPA4 569 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 RAB41Q5JT25 222 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 EOGTQ5NDL2 527 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 NAA35Q5VZE5 725 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ANO7Q6IWH7 933 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TMEM270Q6UE05 265 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 UNC5AQ6ZN44 842 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 STK32CQ86UX6 486 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 KBTBD6Q86V97 674 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ARHGAP18Q8N392 663 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ALLCQ8N6M5 410 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 UBR7Q8N806 425 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TSTD1Q8NFU3 115 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 UBA3Q8TBC4 463 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 BBS2Q9BXC9 721 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 EBF2Q9HAK2 575 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 LRRC4Q9HBW1 653 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 WDR35Q9P2L0 1181 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 DEC1Q9P2X7 70 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 RASAL2Q9UJF2 1139 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TSPAN16Q9UKR8 245 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 KIAA1257Q9ULG3 409 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CKAP5Q14008 2032 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 SLC12A8A0AV02 714 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 GMNCA6NCL1 334 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 SGK1O00141 431 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 O00370 1275 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 DCLK1O15075 740 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 TRIM24O15164 1050 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 CACNG3O60359 315 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 ALDH1A2O94788 518 aa5.44□□□□□ -1.54
LINC00342-201ENST00000412393 RHOBTB1O94844 696 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms