RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM178BH3BS89 294 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GRM8O00222 908 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCDH17O14917 1159 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WDR1O75083 606 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CLSTN1O94985 981 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LYL1P12980 280 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MYOD1P15172 320 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPL17P18621 184 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 STX2P32856 288 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DRD3P35462 400 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CENPAP49450 140 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NEK2P51955 445 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TERF1P54274 439 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CACNB3P54284 484 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EPHB1P54762 984 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPL24P83731 157 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PPARDQ03181 441 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC18A2Q05940 514 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CDK18Q07002 472 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RAPSNQ13702 412 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DAG1Q14118 895 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MPEG1Q2M385 716 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PLEKHG6Q3KR16 790 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRTCAP3Q53RY4 240 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FFAR4Q5NUL3 377 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AADACL2Q6P093 401 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM65Q6PJ69 517 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ASB18Q6ZVZ8 466 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FOXRED2Q8IWF2 684 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF843Q8N446 348 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SCAIQ8N9R8 606 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 YME1L1Q96TA2 773 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SOSTQ9BQB4 213 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYT17Q9BSW7 474 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM31Q9BZY9 425 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PDE11AQ9HCR9 933 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HELLSQ9NRZ9 838 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MCM9Q9NXL9 1143 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MYO1AQ9UBC5 1043 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NLKQ9UBE8 527 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TINAGQ9UJW2 476 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LOXL2Q9Y4K0 774 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A1W2PPR1 153 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C1orf226A1L170 272 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A6NL46 340 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRR32B1ATL7 298 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SRRM5B3KS81 715 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IFNL4K9M1U5 179 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GOLIM4O00461 696 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYNGR3O43761 229 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC25A17O43808 307 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CAVIN2O95810 425 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TSHBP01222 138 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MMP2P08253 660 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM27P14373 513 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IDEP14735 1019 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITIH1P19827 911 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FGFR2P21802 821 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLRK1P26718 216 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AVPR2P30518 371 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TTKP33981 857 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC6A12P48065 614 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SNX16P57768 344 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ISL1P61371 349 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPP30P78346 268 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GRAPQ13588 217 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GTF2H2Q13888 395 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ME3Q16798 604 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KIAA1644Q3SXP7 199 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GXYLT1Q4G148 440 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF569Q5MCW4 686 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SEL1L3Q68CR1 1132 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM171BQ6P995 826 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM64Q6YI46 380 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRBA2Q6ZNG9 492 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ANO5Q75V66 913 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GALNT15Q8N3T1 639 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCDC185Q8N715 623 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RNF152Q8N8N0 203 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM156AQ8NDB6 213 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAGEC3Q8TD91 643 aa0.44□□□□□ -2.34
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