RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 ARSDP51689 593 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 B4GALNT1Q00973 533 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ELP6Q0PNE2 266 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SERINC3Q13530 473 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PHF19Q5T6S3 580 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 OR6C4Q8NGE1 309 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PMEPA1Q969W9 287 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 LGR4Q9BXB1 951 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 RETREG1Q9H6L5 497 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 DGKBQ9Y6T7 804 aa13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 TSPAN11A1L157 253 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 J3KR12 359 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 UCHL3P15374 230 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 GM2AP17900 193 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MMP8P22894 467 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 EPHB2P29323 1055 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MMP12P39900 470 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PTPN9P43378 593 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 RGRP47804 291 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 OR1D5P58170 312 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 FMO1Q01740 532 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 TLE1Q04724 770 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MTM1Q13496 603 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ARHGEF7Q14155 803 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 AMZ1Q400G9 498 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 C14orf28Q4W4Y0 310 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 STRADAQ7RTN6 431 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MSANTD4Q8NCY6 345 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 CMKLR1Q99788 373 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 C11orf70Q9BRQ4 267 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SLC12A9Q9BXP2 914 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SLC25A18Q9H1K4 315 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 DPEP2Q9H4A9 486 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1W2PQC6 194 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 A8MX80 341 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 F8VZ95 297 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 CREB3O43889 395 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 GFPT2O94808 682 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MBD3O95983 291 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 FUCA1P04066 466 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PNLIPP16233 465 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SUOXP51687 545 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MAZP56270 477 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 RALGDSQ12967 914 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PTP4A2Q12974 167 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 AGERQ15109 404 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 WDR59Q6PJI9 974 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SLFN11Q7Z7L1 901 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM159Q96B96 161 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PCDHB18PQ96TA0 734 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 NUDT22Q9BRQ3 303 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 STK33Q9BYT3 514 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 CYP4F12Q9HCS2 524 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PPFIA2O75334 1257 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SFTPCP11686 197 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ALDH4A1P30038 563 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 KLK7P49862 253 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SKIDA1Q1XH10 827 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 MAP9Q49MG5 647 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 EFHC2Q5JST6 749 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 SCYL2Q6P3W7 929 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 LIPIQ6XZB0 460 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PIM3Q86V86 326 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 LURAP1LQ8IV03 231 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ATL2Q8NHH9 583 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 NKD1Q969G9 470 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 NTAN1Q96AB6 310 aa13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-203ENST00000372906 PDFQ9HBH1 243 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms