RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEB16A2A368 324 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SNAP91O60641 907 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL41O60662 606 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AVILO75366 819 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CABYRO75952 493 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ALOX5P09917 674 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CYP2C9P11712 490 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 COL6A2P12110 1019 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CD19P15391 556 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CDH3P22223 829 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 S100A1P23297 94 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NME5P56597 212 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NAA20P61599 178 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 POU5F1BQ06416 359 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PPP2R5DQ14738 602 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CCL14Q16627 93 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFA5Q16718 116 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RGS21Q2M5E4 152 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CASC4Q6P4E1 433 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf87Q6PH81 154 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MAVSQ7Z434 540 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RSPH3Q86UC2 560 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C17orf50Q8WW18 174 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RANBP9Q96S59 729 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TM9SF2Q99805 663 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PKP2Q99959 881 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SRRDQ9UH36 339 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HEATR9A2RTY3 570 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM247A6NEH6 219 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FBP2O00757 339 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ACOT8O14734 319 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SEPT4O43236 478 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB14O43829 449 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FKTNO75072 461 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 IL18RAPO95256 599 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 F2P00734 622 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 VDRP11473 427 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CYBAP13498 195 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 INSRRP14616 1297 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DCKP27707 260 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RBL1P28749 1068 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ATICP31939 592 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BCAP31P51572 246 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HTRA3P83110 453 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NFKB2Q00653 900 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PRKCZQ05513 592 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TUBA3CQ13748 450 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SNX17Q15036 470 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TM4SF20Q53R12 229 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FAM209AQ5JX71 171 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LIPMQ5VYY2 423 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf40Q86WS4 652 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LEMD2Q8NC56 503 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MAGED4Q96JG8 741 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC138Q96M89 665 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MUC13Q9H3R2 512 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SARDHQ9UL12 918 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms