RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365553.1

RNU6-827P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 827, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-827P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-827P-201ENST00000365553 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CKAP5Q14008 2032 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 A0A1W2PPH5 198 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CPED1A4D0V7 1026 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 TMEM202A6NGA9 273 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 J3KRW8 73 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 LDLRAD4O15165 306 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 HSPA12AO43301 675 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ZIC3O60481 467 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 UBL4AP11441 157 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 EDN2P20800 178 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 TNFRSF8P28908 595 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CCKBRP32239 447 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 STX2P32856 288 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 SHMT1P34896 483 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ART1P52961 327 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 RARSP54136 660 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 TUBA1BP68363 451 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 KIF5AQ12840 1032 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 GRIK3Q13003 919 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CCNG2Q16589 344 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CALCRLQ16602 461 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 KRT24Q2M2I5 525 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ZNF585BQ52M93 769 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CDC73Q6P1J9 531 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 TDRPQ86YL5 185 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CERS3Q8IU89 383 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CADM4Q8NFZ8 388 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 MAGEC3Q8TD91 643 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 TMED6Q8WW62 240 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 WASF1Q92558 559 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ERGIC1Q969X5 290 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 FAM149B1Q96BN6 582 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 C7orf26Q96N11 449 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 OR1F2PQ96R84 312 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 FIZ1Q96SL8 496 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 SH3GL2Q99962 352 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ASAH2Q9NR71 780 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 IRAK4Q9NWZ3 460 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 WWOXQ9NZC7 414 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 HAO1Q9UJM8 370 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ZNF580Q9UK33 172 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CDC14AQ9UNH5 594 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ERVK-11Q9UQG0 969 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CAMK2AQ9UQM7 478 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 NFS1Q9Y697 457 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 A0A1W2PRG0 241 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 DENND3A2RUS2 1198 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 C4orf47A7E2U8 309 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 BTBD18B2RXH4 712 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 J3KR12 359 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CCNDBP1O95273 360 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ZNF12P17014 697 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 BSGP35613 385 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 PIGAP37287 484 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 HARS2P49590 506 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 CCR9P51686 369 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 BNC1Q01954 994 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 TRAF3Q13114 568 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 OLIG2Q13516 323 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 NFATC4Q14934 902 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 KIF19Q2TAC6 998 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 USP41Q3LFD5 358 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 AMZ1Q400G9 498 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 SGO1Q5FBB7 561 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 XKR9Q5GH70 373 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 C6orf141Q5SZD1 244 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-827P-201ENST00000365553 LCTLQ6UWM7 567 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms