RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MARK4Q96L34 752 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 E9PAM4 449 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SDHDO14521 159 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 DPP6P42658 865 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDH1A3P47895 512 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FOLH1Q04609 750 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CEACAM7Q14002 265 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 KDELC1Q6UW63 502 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC49Q8IUZ0 686 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP93Q8N1F7 819 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ICA1LQ8NDH6 482 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 POMKQ9H5K3 350 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPC5OSA6NMA1 111 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 GALTP07902 379 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIA2P42262 883 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 WNT3AP56704 352 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF280DQ6N043 979 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SGF29Q96ES7 293 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR41Q9HAD4 459 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 GJB3O75712 270 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PEX11BO96011 259 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CHN2P52757 468 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SEPT6Q14141 434 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FLOT2Q14254 428 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXL19Q6PCT2 694 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO32Q969P5 355 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP13A1Q9HD20 1204 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 DOCK4Q8N1I0 1966 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 NEMP2A6NFY4 417 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 WASH4PA8MWX3 477 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CCL5P13501 91 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC12A2P55011 1212 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MAXP61244 160 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A2Q01362 244 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 BFSP2Q13515 415 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ALFQ53S48 1182 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TECRLQ5HYJ1 363 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ARMC3Q5W041 872 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PELI3Q8N2H9 469 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SEPT8Q92599 483 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SQORQ9Y6N5 450 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MTMR11A4FU01 709 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PKNOX1P55347 436 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP52Q8N1V2 620 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 OLFM1Q99784 485 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD33BA6NCL7 494 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CAPN8A6NHC0 703 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CFLARO15519 480 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PFKPQ01813 784 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SULT2A1Q06520 285 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ART3Q13508 389 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CSHL1Q14406 222 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM83EQ2M2I3 478 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MARVELD2Q8N4S9 558 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf74Q96LT6 269 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FNIP2Q9P278 1114 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTL7AQ9Y615 435 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 HEATR9A2RTY3 570 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNA5P22460 613 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ME2P23368 584 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PAX3P23760 479 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1D2P34982 312 aa18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms