RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KLC4Q9NSK0 619 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.692e-10■■■■□ 19.3
PTPRC-201ENST00000348564 DNPEPQ9ULA0 475 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ALG6Q9Y672 507 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP33O14559 1287 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN6O43657 245 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IFNA16P05015 189 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 ANXA5P08758 320 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 CDK18Q07002 472 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 CAMK1Q14012 370 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 C8orf74Q6P047 294 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 HTR3DQ70Z44 454 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC35F6Q8N357 371 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CEP112Q8N8E3 955 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A18Q96N87 628 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HGH1Q9BTY7 390 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 DRC3Q9H069 523 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GOLPH3Q9H4A6 298 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 WDR81Q562E7 1941 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0U1RQJ8 604 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 K7ERQ8 282 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TLR4O00206 839 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.75e-7■■■■■ 31.5
PTPRC-201ENST00000348564 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CD27P26842 260 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RPL10P27635 214 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PRKCIP41743 596 aa4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ITGA9Q13797 1035 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SPARCL1Q14515 664 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NAB2Q15742 525 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00523Q86TU6 105 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM126BQ8IUX1 230 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SNX31Q8N9S9 440 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ARMC2Q8NEN0 867 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 EXD1Q8NHP7 514 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 COL26A1Q96A83 441 aa4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 KLHL25Q9H0H3 589 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PADI4Q9UM07 663 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0D9SEW6 157 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 A8MUI8 341 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GFRA2O00451 464 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PIGNO95427 931 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TUBB4AP04350 444 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PHBP35232 272 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GCKP35557 465 aa4.46□□□□□ -1.7
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