RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326427.10

ITM2C-202, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-202ENST00000326427 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PLXNA3P51805 1871 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 MROH6A6NGR9 719 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 VILLO15195 856 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 GPR182O15218 404 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 POMCP01189 267 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 IGHA2P01877 340 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 NDST2P52849 883 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PLK1P53350 603 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 MGAT3Q09327 533 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 SPNS2Q8IVW8 549 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 GALNT4Q8N4A0 578 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 HASPINQ8TF76 798 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 MYADML2A6NDP7 307 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 MMP2P08253 660 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 FKBP1BP68106 108 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 NFKB2Q00653 900 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.131e-7■□□□□ 10.4
ITM2C-202ENST00000326427 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PHF21BQ96EK2 531 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 NT5MQ9NPB1 228 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PTTG2Q9NZH5 202 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 GPC4O75487 556 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 S1PR4O95977 384 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 GRIK1P39086 918 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 CD86P42081 329 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 ACADVLP49748 655 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TUSC3Q13454 348 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 NADK2Q4G0N4 442 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 LPGAT1Q92604 370 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF597Q96LX8 424 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 APPL1Q9UKG1 709 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TTC3P53804 2025 aa22.08■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 A0A1W2PQH9 124 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 MRASO14807 208 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 KPNA6O60684 536 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 HDCP19113 662 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 CDKN2DP55273 166 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 TNK2Q07912 1038 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 ISCA2Q86U28 154 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 EME1Q96AY2 570 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 TADA1Q96BN2 335 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 SLC39A13Q96H72 371 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 SUSD3Q96L08 255 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 NRP2O60462 931 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 MGEA5O60502 916 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 TYMPP19971 482 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 SLC7A1P30825 629 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 IHHQ14623 411 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 SERINC5Q86VE9 423 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 DDI1Q8WTU0 396 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 HMCESQ96FZ2 354 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 UROC1Q96N76 676 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 GLTPD2A6NH11 291 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 J3KR12 359 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 RHOQP17081 205 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 RALGDSQ12967 914 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 MARC1Q5VT66 337 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 TEX26Q8N6G2 289 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 ALG9Q9H6U8 611 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 CROTQ9UKG9 612 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.06■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ITM2C-202ENST00000326427 ITGB1P05556 798 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms