RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCNM1Q9BWG6 230 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCKL1Q9NWZ5 548 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC28Q9NX36 388 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMPACTQ9P2X3 320 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRBP23467 1997 aa19.64■□□□□ 0.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELFN1P0C7U0 828 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 DGKAP23743 735 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 YPEL5P62699 121 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITKQ08881 620 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB17Q13105 803 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ODF2Q5BJF6 829 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KATNAL2Q8IYT4 538 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARRDC2Q8TBH0 407 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL12RB2Q99665 862 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 LACRTQ9GZZ8 138 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF15Q9UIH9 416 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK13Q9UKR3 277 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTLL3Q9Y4R7 772 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAI2Q9Y5P3 530 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP10Q9Y6W6 482 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8CPA6NN73 597 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTNL10A8MVZ5 291 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 A8MX80 341 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK1O00180 336 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENC1O14682 589 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PJA2O43164 708 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 FZD6O60353 706 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSF2P04141 144 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIMD1P0DJR0 217 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 VIPR1P32241 457 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 VAV2P52735 878 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 THOP1P52888 689 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NIPAL4Q0D2K0 466 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNGA3Q16281 694 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMC12Q5T9G4 340 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAAM2Q86T65 1068 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIH1D2Q8WWB5 315 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT35Q92764 455 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHTF1Q9UMS5 762 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKAP13Q12802 2813 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGF2RP11717 2491 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM38O00635 465 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOR1BO14657 336 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEBLO76041 1014 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 JCHAINP01591 159 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCCBP05166 539 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDHA1P08559 390 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT10P13645 584 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHCGRP22888 699 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADCY2Q08462 1091 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP1B1Q10567 949 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC3Q13217 504 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDK1Q15118 436 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 LLGL1Q15334 1064 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 MACC1Q6ZN28 852 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTD1Q8N815 330 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 COQ10AQ96MF6 247 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAUS2Q9NVX0 235 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPG5Q9HCE0 2579 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BM21 787 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 FFAR2O15552 330 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIGLEC6O43699 453 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTPS1P17812 591 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CES1P23141 567 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACADVLP49748 655 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTM1Q13496 603 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFDP2Q14188 446 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTK2BQ14289 1009 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRRQ15256 657 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROX2Q3B8N5 592 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFDP3Q5H9I0 405 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM182AQ5T1J6 154 aa19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms