RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 KRT36O76013 467 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 GOT2P00505 430 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SLC26A3P40879 764 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PFKPQ01813 784 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RCN1Q15293 331 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CHST9Q7L1S5 443 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.084e-7■■□□□ 12.1
SPHK1-201ENST00000323374 GPR150Q8NGU9 434 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CNDP1Q96KN2 507 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TRIB3Q96RU7 358 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 STOML1Q9UBI4 398 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.83■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 KLF10Q13118 480 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC6Q16204 474 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ADGRF1Q5T601 910 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 NUF2Q9BZD4 464 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 YIPF1Q9Y548 306 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1B0GVM2 712 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 NEMP1O14524 444 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 EPHA3P29320 983 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CDKN2DP55273 166 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PLD1Q13393 1074 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 OR13C4Q8NGS5 318 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RNF38Q9H0F5 515 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CDYLQ9Y232 598 aa21.82■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 LOC100653049A0A140TA62 436 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 INSIG1O15503 277 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 KRT34O76011 436 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PIRTP0C851 137 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 COX4I1P13073 169 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SCNN1BP51168 640 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SGSHP51688 502 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PTPRCAPQ14761 206 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RNF208Q9H0X6 261 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.81■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 A0A088AWK7 358 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 NEMP2A6NFY4 417 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CRTAMO95727 393 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 IRF1P10914 325 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 DSG1Q02413 1049 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 VEPH1Q14D04 833 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 KDM1BQ8NB78 822 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 OR4L1Q8NH43 312 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 C2orf78A6NCI8 922 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 A8MT66 165 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TSPAN3O60637 253 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CES1P23141 567 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RGRP47804 291 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PPP3CCP48454 512 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TLE2Q04725 743 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM169Q96HH4 297 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TOX2Q96NM4 488 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.8■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 VGLL3A8MV65 326 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CBX4O00257 560 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CR2P20023 1033 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 GCKP35557 465 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ACTR3P61158 418 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms