RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 POLD2P49005 469 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MAXP61244 160 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 INSCQ1MX18 579 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PYDC2Q56P42 97 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CRTC3Q6UUV7 619 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CHRAC1Q9NRG0 131 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CATSPERZQ9NTU4 200 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 AHSPQ9NZD4 102 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 POMPQ9Y244 141 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NRP2O60462 931 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NTRK1P04629 796 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CDK9P50750 372 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CYP4F2P78329 520 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CYP4F3Q08477 520 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 STARD3Q14849 445 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ANO7Q6IWH7 933 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 RHOJQ9H4E5 214 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MFSD11O43934 449 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CYP2A7P20853 494 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 HOXD13P35453 343 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CRY2Q49AN0 593 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF544Q6NX49 715 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SLC4A11Q8NBS3 891 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 VPS35Q96QK1 796 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CILPO75339 1184 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SH3BGRLO75368 114 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CFHP08603 1231 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CSH1P0DML2 217 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CSH2P0DML3 217 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ABATP80404 500 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GALNT18Q6P9A2 607 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SLCO2A1Q92959 643 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ATP13A1Q9HD20 1204 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CLN6Q9NWW5 311 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 STON1Q9Y6Q2 735 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PTSQ03393 145 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CUZD1Q86UP6 607 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM74Q86UV6 250 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM73Q86UV7 250 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MFSD3Q96ES6 412 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CMTM6Q9NX76 183 aa18.74■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 COX7A2P14406 83 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 IDH3AP50213 366 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 AKR1D1P51857 326 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 LCLAT1Q6UWP7 414 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CDYL2Q8N8U2 506 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MCOLN3Q8TDD5 553 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 STARD8Q92502 1023 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GSTM5P46439 218 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 FAR1Q8WVX9 515 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 LPGAT1Q92604 370 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.595e-6■■■■□ 20.3
PRKCI-201ENST00000295797 PCDHGC3Q9UN70 934 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 B4GALT4O60513 344 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ITGAXP20702 1163 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZFP69Q49AA0 526 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CITED4Q96RK1 184 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CXorf21Q9HAI6 301 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TELO2Q9Y4R8 837 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SPACA6W5XKT8 324 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 CAMKK1Q8N5S9 505 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MED8Q96G25 268 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ING3Q9NXR8 418 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ACTR3P61158 418 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 SELENOMQ8WWX9 145 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 AZIN2Q96A70 460 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF222Q9UK12 451 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.72■□□□□ 0.59
PRKCI-201ENST00000295797 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms