RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 TYRP14679 529 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC7-201ENST00000277657 IFT88Q13099 833 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC153Q494R4 210 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC7-201ENST00000277657 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CNSTQ6PJW8 725 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC7-201ENST00000277657 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC7-201ENST00000277657 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC7-201ENST00000277657 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC7-201ENST00000277657 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.14■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 SLC8A1P32418 973 aa22.14■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF358Q9NW07 568 aa22.14■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 C2orf81A6NN90 581 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 PGLSO95336 258 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 GLP2RO95838 553 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 OR4L1Q8NH43 312 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 OMDQ99983 421 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 EPOPA6NHQ4 379 aa22.12■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 SAT1P21673 171 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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CCDC7-201ENST00000277657 RAB30Q15771 203 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CHI3L2Q15782 390 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CES4AQ5XG92 561 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ATG16L1Q676U5 607 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.12■■□□□ 1.13
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