RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 TRPC5OSA6NMA1 111 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM114B3SHH9 223 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MAFKO60675 156 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 RFPL1O75677 317 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SOD2P04179 222 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 CCNFP41002 786 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 RD3Q7Z3Z2 195 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM135Q86UB9 458 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SLC22A9Q8IVM8 553 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 AGAP2Q99490 1192 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 COPG2Q9UBF2 871 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MTRRQ9UBK8 725 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 YIPF1Q9Y548 306 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF10BO14763 440 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ART3Q13508 389 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MBTPS1Q14703 1052 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 PIK3R6Q5UE93 754 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 VWCEQ96DN2 955 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 CCND1P24385 295 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MAGEA3P43357 314 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 NCALDP61601 193 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 USP46P62068 366 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 OLIG2Q13516 323 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 FRA10AC1Q70Z53 315 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 C10orf107Q8IVU9 208 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MFN1Q8IWA4 741 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ING5Q8WYH8 240 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 CAB39LQ9H9S4 337 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 NDE1Q9NXR1 346 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TBL1XO60907 577 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 GRM3Q14832 879 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 PPM1JQ5JR12 505 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 DEFB123Q8N688 67 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 HDAC10Q969S8 669 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6V1E2Q96A05 226 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 DRC3Q9H069 523 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 NOD2Q9HC29 1040 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 CATSPERZQ9NTU4 200 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 HACD3Q9P035 362 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF510Q9Y2H8 683 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 OBSL1O75147 1896 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 WASH4PA8MWX3 477 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MAP3K7O43318 606 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 VPS26AO75436 327 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 CNTN5O94779 1100 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 CBX6O95503 412 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 NDST3O95803 873 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MAGEA8P43361 318 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 NIPAL4Q0D2K0 466 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 RCN1Q15293 331 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SNX30Q5VWJ9 437 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 FAM45BPQ6NSW5 357 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 UGT3A1Q6NUS8 523 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 FAM45AQ8TCE6 357 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 C10orf82Q8WW14 230 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 J3KR12 359 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 CD68P34810 354 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 KCNQ1P51787 676 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 MUM1Q2TAK8 710 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF534Q76KX8 674 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TEX9Q8N6V9 391 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 OR7D4Q8NG98 312 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.67□□□□□ -0.7
PRRX1-201ENST00000239461 TCF25Q9BQ70 676 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms