RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237014.7

TTR-201, Transcript of transthyretin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTR, Length 957 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-201ENST00000237014 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 TEX26Q8N6G2 289 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 KCTD6Q8NC69 237 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SAP25Q8TEE9 199 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 RAB7BQ96AH8 199 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 BMFQ96LC9 184 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ZNF599Q96NL3 588 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 NOD2Q9HC29 1040 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 GDF3Q9NR23 364 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 DTLQ9NZJ0 730 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SEPT3Q9UH03 358 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 FRYQ5TBA9 3013 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 AKAP13Q12802 2813 aa7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 IGF2RP11717 2491 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ZNF487B1APH4 448 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 FLRT2O43155 660 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 NDUFA10O95299 355 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 KRT1P04264 644 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 THEGLP0DJG4 465 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 GM2AP17900 193 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 CDC25BP30305 580 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 AKT2P31751 481 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 MMP13P45452 471 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SCNN1BP51168 640 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 AP1S1P61966 158 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 RAD51Q06609 339 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ADCY2Q08462 1091 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 CCDC15Q0P6D6 951 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 OVGP1Q12889 678 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 TRAF2Q12933 501 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 BNIP3Q12983 259 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ZNF235Q14590 738 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 STAT4Q14765 748 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PTPRRQ15256 657 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 TAZQ16635 292 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 UGP2Q16851 508 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 LRRC38Q5VT99 294 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 NPNTQ6UXI9 565 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 GLRX5Q86SX6 157 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 TTC7BQ86TV6 843 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ASB12Q8WXK4 309 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 MAML1Q92585 1016 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 KRT35Q92764 455 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 CENPTQ96BT3 561 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 FEM1CQ96JP0 617 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 OLFM3Q96PB7 478 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 RNF157Q96PX1 679 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SMIM14Q96QK8 99 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SLC32A1Q9H598 525 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PTPRBP23467 1997 aa7.35□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 A6NNZ2 444 aa7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 NEMP1O14524 444 aa7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 PSTPIP1O43586 416 aa7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 SDC3O75056 442 aa7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 DKK1O94907 266 aa7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 HLA-DQB2P05538 268 aa7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTR-201ENST00000237014 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.34□□□□□ -1.23
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