RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pik3cdO35904 1043 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stam2O88811 523 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd4P06332 457 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtsdP18242 410 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifrd1P19182 449 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crhr1P35347 415 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 VegfbP49766 207 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncf4P97369 339 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajb14Q149L6 379 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q32M26 199 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serac1Q3U213 654 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GpamQ61586 827 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpa4Q6P8K8 420 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Samd3Q8C4H2 520 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KyQ8C8H8 661 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5591Q8CDK1 855 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb19Q8K3I8 83 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BfarQ8R079 450 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gsg1Q8R1W2 324 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspan33Q8R3S2 283 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RhoqQ8R527 205 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Toe1Q9D2E2 511 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atad1Q9D5T0 361 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il1rl2Q9ERS7 574 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prmt1Q9JIF0 371 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GraspQ9JJA9 392 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Copg1Q9QZE5 874 aa21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm28168A0A087WNP1 180 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5483B2RV77 97 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hes2O54792 157 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oas1aP11928 367 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Npr1P18293 1057 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbp1Q00915 135 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Msx2Q03358 267 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp217Q3U0X6 1041 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sh3gl3Q62421 347 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc39a14Q75N73 489 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Amz1Q8BVF9 502 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Peli3Q8BXR6 445 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp45Q8K387 813 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oas1gQ8K469 367 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ProzQ9CQW3 399 aa21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zmynd12A2BGJ5 363 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc6a20bO88575 635 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Man1a1P45700 655 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Colec11Q3SXB8 272 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc127Q3TC33 260 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpn14Q62130 1189 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PolnQ7TQ07 864 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mib1Q80SY4 1006 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem202Q80W35 275 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psapl1Q8C1C1 522 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mark4Q8CIP4 752 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vwa1Q8R2Z5 415 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr847Q8VFF4 312 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspan11Q9D1D1 253 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efhc1Q9D9T8 648 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufa13Q9ERS2 144 aa21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zmpste24Q80W54 475 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp2c1Q80XR2 918 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Noc4lQ8BHY2 516 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abi1Q8CBW3 481 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TwnkQ8CIW5 685 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ipo13Q8K0C1 963 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DolkQ8R2Y3 534 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr665Q8VG79 316 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smim11aQ99J19 55 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pmf1Q9CPV5 202 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndst3Q9EQH7 873 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Maged2Q9ER67 616 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mpp6Q9JLB0 553 aa21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20828J3KMI7 228 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm11236J3QMS7 360 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox2gL7MUB9 191 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ldb2O55203 373 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LtfP08071 707 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il6raP22272 460 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acvr1P37172 509 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Flt3lgP49772 232 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plk2P53351 682 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FsbpQ8BKE5 299 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GancQ8BVW0 898 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taf10Q8K0H5 218 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rprd1aQ8VDS4 312 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr695Q8VFM3 315 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhga10Q91XY9 930 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim8Q99PJ2 551 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anks3Q9CZK6 655 aa21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ighg3A0A1Y7VJN6 399 aa21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttll9A2APC3 461 aa21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.9 ms