RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cldn24D3YXJ9 220 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Socs2O35717 198 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CrymO54983 313 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-Eb1P04230 264 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pag1Q3U1F9 429 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam117bQ3U3E2 584 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akr1clQ3UXL1 322 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam20cQ5MJS3 579 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp658Q5PPQ4 887 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gngt2Q61017 69 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssxb3Q6XAS4 170 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina3bQ8BYY9 420 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem154Q8C4Q9 181 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr11Q8K1X1 1223 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abtb1Q99LJ2 478 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Them5Q9CQJ0 248 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MajinQ9D992 256 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtsrQ9JIA9 334 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spag4Q9JJF2 443 aa16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp963D3Z2T8 383 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kctd18E0CZ26 429 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17175E9Q528 179 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sbk3P0C5K0 361 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FlgP11088 336 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BmxP97504 651 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Efr3bQ6ZQ18 817 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zmiz2Q8CIE2 920 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GrpQ8R1I2 146 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MiosQ8VE19 875 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtsqQ91ZF4 343 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddit4Q9D3F7 229 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Morc1Q9WVL5 950 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r24D3YUI0 854 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm6685D3YYP3 228 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SmgcF6VRN1 385 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox6O70238 227 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PkdccQ5RJI4 492 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SvopQ8BFT9 548 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nmur2Q8BZ39 395 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sfrp1Q8C4U3 314 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RtknQ8C6B2 564 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gfm2Q8R2Q4 779 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fuca1Q99LJ1 452 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Leng1Q9DB98 261 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syvn1Q9DBY1 612 aa16.14■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10717D3Z1I8 228 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r96E9PZU5 664 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp3ccP48455 513 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pld2P97813 933 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnh1Q60603 989 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcg2Q7TMS5 657 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nacc1Q7TSZ8 514 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Reps2Q80XA6 521 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem220Q8BP07 167 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LnpepQ8C129 1025 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3glb1Q9JK48 365 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Skint6A7XUZ6 1240 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psmb10O35955 273 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arl1P61211 181 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SirpaP97797 513 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Magee2Q52KG3 523 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Unc93b1Q8VCW4 598 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf24Q91VN1 368 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TmlheQ91ZE0 421 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q922R1 422 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdelc1Q9JHP7 502 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pex11bQ9Z210 259 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp985A2A7A5 519 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5483B2RV77 97 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sema3aO08665 772 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eci1P42125 289 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ArsaP50428 506 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Naa50Q6PGB6 169 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmcc2Q80W04 706 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps39Q8R5L3 886 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rwdd4Q9CPR1 188 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hacd2Q9D3B1 254 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Htr3bQ9JHJ5 437 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hao2Q9NYQ2 353 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd320Q9Z1P5 260 aa16.13■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trbv4A0A075B5I2 113 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mroh7A2AVR2 1279 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3636E9Q5P1 227 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1022L7MTT3 315 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EgfP01132 1217 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc153P0C7Q1 202 aa16.12■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcpt1P11034 246 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.5 ms