RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

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Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 SIRPB2Q5JXA9 342 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 LPCAT4Q643R3 524 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 CMTM8Q8IZV2 173 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 WBP2Q969T9 261 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 OLFM3Q96PB7 478 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 RNF38Q9H0F5 515 aa7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PKP3Q9Y446 797 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 C2orf81A6NN90 581 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 PRKCHP24723 683 aa7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 HHLA1C9JL84 531 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 MUSKO15146 869 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SMIM24O75264 130 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 NEK3P51956 506 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 EPHB3P54753 998 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ARHGEF7Q14155 803 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ENO4A6NNW6 628 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 ZNF623O75123 536 aa7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 SEC24AO95486 1093 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 T-ENOLP0DO92 83 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 CCL5P13501 91 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PSMC3P17980 439 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 MC4RP32245 332 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 IDH3AP50213 366 aa7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 CYTH1Q15438 398 aa7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-217ENST00000628904 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 RHOJQ9H4E5 214 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 PPCSQ9HAB8 311 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 RRN3Q9NYV6 651 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 Q9Y3F1 56 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-217ENST00000628904 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.54□□□□□ -1.2
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