RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623935.1

SOX9-AS1-217, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 1,563 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HLA-EP13747 358 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TSHRP16473 764 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TPH1P17752 444 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PGAM1P18669 254 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ADRA1DP25100 572 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NTSR1P30989 418 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IL12RB1P42701 662 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MAGEA3P43357 314 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CBLBQ13191 982 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OLIG2Q13516 323 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SEPT6Q14141 434 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LRRC32Q14392 662 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GALNT3Q14435 633 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 POU6F1Q14863 301 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KYNUQ16719 465 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ARSIQ5FYB1 569 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 EMC10Q5UCC4 262 aa8.6□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 USP45Q70EL2 814 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF534Q76KX8 674 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF366Q8N895 744 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C9orf72Q96LT7 481 aa8.6□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 ASB2Q96Q27 587 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NELL2Q99435 816 aa8.6□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FBRSQ9HAH7 460 aa8.6□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CA14Q9ULX7 337 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RIPK2O43353 540 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 LEFTY1O75610 366 aa8.59□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 STK40Q8N2I9 435 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CHST14Q8NCH0 376 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMIEQ8NEW7 156 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CDKL2Q92772 493 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CFAP36Q96G28 342 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.59□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 RANBP9Q96S59 729 aa8.59□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SYBUQ9NX95 663 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
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SOX9-AS1-217ENST00000623935 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-217ENST00000623935 EYSQ5T1H1 3165 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ATP8B1O43520 1251 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FZD6O60353 706 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ATG13O75143 517 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BANF1O75531 89 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 USP1O94782 785 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IVLP07476 585 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PDHA1P08559 390 aa8.58□□□□□ -1.04
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