RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623706.3

ATRX-212, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 2

Gene ATRX, Length 7,245 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-212ENST00000623706 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 B2RBV5 119 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 SYN3O14994 580 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TPST1O60507 370 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 JAK2O60674 1132 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CYP4B1P13584 511 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 UQCRFS1P47985 274 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 THBS3P49746 956 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 GNAQP50148 359 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PTTG1IPP53801 180 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 SP4Q02446 784 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CENPCQ03188 943 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TUBB2AQ13885 445 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PTPAQ15257 358 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TIGD5Q53EQ6 642 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ERASQ7Z444 233 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 GHDCQ8N2G8 530 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 OR2L5Q8NG80 312 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 POMKQ9H5K3 350 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TMEM206Q9H813 350 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 MANSC1Q9H8J5 431 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 LY9Q9HBG7 655 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CTNND2Q9UQB3 1225 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 WDR45Q9Y484 360 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ASB3Q9Y575 518 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 SERPINF2P08697 491 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CD19P15391 556 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ITGA2P17301 1181 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TGM2P21980 687 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ACTA2P62736 377 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ACTC1P68032 377 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ACTA1P68133 377 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 MTMR2Q13614 643 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CES4AQ5XG92 561 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 LINGO2Q7L985 606 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 SPATA19Q7Z5L4 167 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 UNC5CLQ8IV45 518 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 FAM47BQ8NA70 645 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 AVL9Q8NBF6 648 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 MALSU1Q96EH3 234 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 OR51E2Q9H255 320 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CRLF2Q9HC73 371 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 UBN2Q6ZU65 1347 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CASKO14936 926 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 KERAO60938 352 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 GLSO94925 669 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 MATN4O95460 622 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 OR52Z1P0C646 297 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 CKBP12277 381 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TSHRP16473 764 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 RXRBP28702 533 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 FNTBP49356 437 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 MEOX1P50221 254 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 GNAI1P63096 354 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 OGDHQ02218 1023 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 PTGR1Q14914 329 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 TLR1Q15399 786 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 MPPE1Q53F39 396 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.5□□□□□ -1.85
ATRX-212ENST00000623706 SFRP1Q8N474 314 aa3.5□□□□□ -1.85
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