RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608369.1

LINC00963-211, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00963, Length 961 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-211ENST00000608369 AADATQ8N5Z0 425 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 EMC1Q8N766 993 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 NTAN1Q96AB6 310 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 HAUS1Q96CS2 278 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 CRELD1Q96HD1 420 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 BTN2A3PQ96KV6 586 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FAM129BQ96TA1 746 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 LGMNQ99538 433 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DPH1Q9BZG8 443 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 EBF2Q9HAK2 575 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF446Q9NWS9 450 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 TENM4Q6N022 2769 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 TULP2O00295 520 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 LCP1P13796 627 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 GJC1P36383 396 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 PTGIRP43119 386 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 PSMD8P48556 350 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 NR2C2P49116 596 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DAB2P98082 770 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 SLC7A5Q01650 507 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 KRT81Q14533 505 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 SLMAPQ14BN4 828 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DPYSL2Q16555 572 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 BNIPLQ7Z465 357 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 OR4C6Q8NH72 309 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 PTPRN2Q92932 1015 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FAF2Q96CS3 445 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 SNF8Q96H20 258 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 SLC39A13Q96H72 371 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 CCDC114Q96M63 670 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 RUFY1Q96T51 708 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FMO2Q99518 471 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FERMT1Q9BQL6 677 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 THSD1Q9NS62 852 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 MYLKQ15746 1914 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 A0A1B0GVM2 712 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 TTC34A8MYJ7 566 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 F5H5T6 163 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 MCF2LO15068 1137 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 LIASO43766 372 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 OPA1O60313 960 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 GJB6O95452 261 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 MT-CO3P00414 261 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 PRB1P04280 392 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 CKMT1AP12532 417 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DRD3P35462 400 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 ARL4AP40617 200 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 LSSP48449 732 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 CXADRP78310 365 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 DCAF6Q58WW2 860 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 NADSYN1Q6IA69 706 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 PCGF5Q86SE9 256 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 CNPY4Q8N129 248 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 IFT81Q8WYA0 676 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 RNF34Q969K3 372 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 HIC2Q96JB3 615 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 NPY6RQ99463 290 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00963-211ENST00000608369 ZWILCHQ9H900 591 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms