RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 S1PR1P21453 382 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 YWHAQP27348 245 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 GSTM2P28161 218 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHATP28329 748 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAP2K2P36507 400 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PIGAP37287 484 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 USP8P40818 1118 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRT6CP48668 564 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TERF1P54274 439 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CACNB3P54284 484 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPARDQ03181 441 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CAPSQ13938 189 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TECRLQ5HYJ1 363 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 DCST1Q5T197 706 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 WDR73Q6P4I2 378 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAQR6Q6TCH4 344 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 HPS6Q86YV9 775 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TPH2Q8IWU9 490 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC39A11Q8N1S5 342 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PARP8Q8N3A8 854 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCDC150Q8NCX0 1101 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAGEC3Q8TD91 643 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PARD3BQ8TEW8 1205 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 OMA1Q96E52 524 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PIGQQ9BRB3 760 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 MECRQ9BV79 373 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 IFT27Q9BW83 186 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RTN4RQ9BZR6 473 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCDC134Q9H6E4 229 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 HELLSQ9NRZ9 838 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATAD3AQ9NVI7 634 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 MCM9Q9NXL9 1143 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKRD10Q9NXR5 420 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 GRHL1Q9NZI5 618 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CA14Q9ULX7 337 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A0U1RQF3 1178 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A1W2PPI3 338 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 HMX3A6NHT5 357 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 NPIPB13A6NJU9 1138 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 C17orf100A8MU93 164 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRR32B1ATL7 298 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM178BH3BS89 294 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PHOX2AO14813 284 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RASA4O43374 803 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPP40O75818 363 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNFRSF6BO95407 300 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 NDST3O95803 873 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CAVIN2O95810 425 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 HRGP04196 525 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CTPS1P17812 591 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 FGFR2P21802 821 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 STX2P32856 288 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TTKP33981 857 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMPOP42166 694 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 CENPAP49450 140 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 NEK2P51955 445 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RCAN1P53805 252 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 EPHB1P54762 984 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPL24P83731 157 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC18A2Q05940 514 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 GTF2H2Q13888 395 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 DAG1Q14118 895 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 GBX1Q14549 363 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PLEKHG6Q3KR16 790 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 SIRPB2Q5JXA9 342 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 BHLHB9Q6PI77 547 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 ASB18Q6ZVZ8 466 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 MON1AQ86VX9 555 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 FOXRED2Q8IWF2 684 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 DENND6AQ8IWF6 608 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 SFTPA2Q8IWL1 248 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCN4BQ8IWT1 228 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF34Q8IZ26 560 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 VPS52Q8N1B4 723 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCML4Q8N228 414 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNF152Q8N8N0 203 aa0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms