RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 SCAMP5Q8TAC9 235 aa10.77□□□□□ -0.68
FCHO1-216ENST00000596536 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.77□□□□□ -0.68
FCHO1-216ENST00000596536 PHF21BQ96EK2 531 aa10.77□□□□□ -0.68
FCHO1-216ENST00000596536 PTPN18Q99952 460 aa10.77□□□□□ -0.68
FCHO1-216ENST00000596536 RTKNQ9BST9 563 aa10.77□□□□□ -0.68
FCHO1-216ENST00000596536 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.77□□□□□ -0.68
FCHO1-216ENST00000596536 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
FCHO1-216ENST00000596536 FBXW11Q9UKB1 542 aa10.77□□□□□ -0.68
FCHO1-216ENST00000596536 RGSL1A5PLK6 1076 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 KCNU1A8MYU2 1149 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PGK1P00558 417 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 MPOP05164 745 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF12P17014 697 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 BDNFP23560 247 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 RCVRNP35243 200 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 CXCR3P49682 368 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 NUP107P57740 925 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 RALGDSQ12967 914 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF789Q5FWF6 425 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 LIPMQ5VYY2 423 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 KCTD11Q693B1 232 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 FAM35AQ86V20 835 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 LILRA2Q8N149 483 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 EXT2Q93063 718 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 NT5C3BQ969T7 300 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 WDR41Q9HAD4 459 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 CDYLQ9Y232 598 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 MYO7AQ13402 2215 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 C9JVG2 144 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TRPC1P48995 793 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF470Q6ECI4 717 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 CYP2R1Q6VVX0 501 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 GPR142Q7Z601 462 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 LSMEM2Q8N112 164 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 JADE3Q92613 823 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PKP2Q99959 881 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.77□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 COL1A2P08123 1366 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 MYL4P12829 197 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 MAGEA12P43365 314 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 RPL34P49207 117 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PGFP49763 221 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TAS2R39P59534 338 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 CDH17Q12864 832 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 NAB1Q13506 487 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TAC4Q86UU9 113 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TEKT5Q96M29 485 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 SLC2A13Q96QE2 648 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TINF2Q9BSI4 451 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 IL22Q9GZX6 179 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 FAM96AQ9H5X1 160 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 MPP6Q9NZW5 540 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ACOT9Q9Y305 439 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 DDHD2O94830 711 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 FBXO21O94952 628 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 KCNA5P22460 613 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PNPLA4P41247 253 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 MAXP61244 160 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TRIML2Q8N7C3 387 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 SHCBP1Q8NEM2 672 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 BORCS5Q969J3 196 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 KLHL32Q96NJ5 620 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 POMKQ9H5K3 350 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 MIOSQ9NXC5 875 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 DKK3Q9UBP4 350 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 STK39Q9UEW8 545 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 TTC3P53804 2025 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 DOCK3Q8IZD9 2030 aa10.76□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PQ67 120 aa10.75□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.75□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 SLC1A2P43004 574 aa10.75□□□□□ -0.69
FCHO1-216ENST00000596536 C21orf59P57076 290 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms