RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC25A45Q8N413 288 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 TEX26Q8N6G2 289 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 PLD5Q8N7P1 536 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 NETO2Q8NC67 525 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 OR13H1Q8NG92 308 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ALG3Q92685 438 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 RAB7BQ96AH8 199 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 HMCESQ96FZ2 354 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 HES6Q96HZ4 224 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 BMFQ96LC9 184 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF599Q96NL3 588 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 DESI2Q9BSY9 194 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ZWILCHQ9H900 591 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ZZEF1O43149 2961 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 LRP4O75096 1905 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 TSPAN11A1L157 253 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 POM121BA6NF01 834 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLON5A6NGN9 336 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 A6NNZ2 444 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 TAF4O00268 1085 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 NEMP1O14524 444 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 AREL1O15033 823 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 RAD51BO15315 384 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 INSIG1O15503 277 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 SPINT1O43278 529 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 MAFKO60675 156 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 SDC3O75056 442 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 IGSF6O95976 241 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CKMT2P17540 419 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CR2P20023 1033 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 AMPD1P23109 780 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 DGKAP23743 735 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ARL4AP40617 200 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CSNK1DP48730 415 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ACADVLP49748 655 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CDH6P55285 790 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 RAD51Q06609 339 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 SGCGQ13326 291 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CAMK2BQ13554 666 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CYTH1Q15438 398 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZSR6 202 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 TTC7BQ86TV6 843 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 PROSER1Q86XN7 944 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 EXD1Q8NHP7 514 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ASB12Q8WXK4 309 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 MAML1Q92585 1016 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 KRT35Q92764 455 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 HDAC11Q96DB2 347 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 IFT43Q96FT9 208 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF157Q96PX1 679 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 PSKH2Q96QS6 385 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CALN1Q9BXU9 219 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR27Q9NS67 375 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 KCND1Q9NSA2 647 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 LHX3Q9UBR4 397 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 GGT7Q9UJ14 662 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ITM2BQ9Y287 266 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC66A2RUB6 948 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM149AA5PLN7 773 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 J3KR12 359 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM38O00635 465 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-210ENST00000588340 FPGTO14772 594 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms