RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PQ67	120 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PR77	199 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	RAD51B	O15315	384 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	KCNN4	O15554	427 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TSPAN6	O43657	245 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	FGG	P02679	453 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	WNT1	P04628	370 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ZNF806	P0C7X5	589 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PRLR	P16471	622 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CES1	P23141	567 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	DPP6	P42658	865 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SEMG2	Q02383	582 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ELP6	Q0PNE2	266 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CSRP2	Q16527	193 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	FAM186A	A6NE01	2351 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538		A0A0J9YYE9	177 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538		A0A1B0GTW7	788 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538		F5H423	210 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CES2	O00748	559 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CEP104	O60308	925 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	NEBL	O76041	1014 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TRBC1	P01850	177 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	C6	P13671	934 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PSMB4	P28070	264 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	IGFALS	P35858	605 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	NUDT1	P36639	197 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ITK	Q08881	620 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	AGER	Q15109	404 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CNGA3	Q16281	694 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	QPCT	Q16769	361 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	KLK6	Q92876	244 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PBK	Q96KB5	322 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	LYSMD1	Q96S90	227 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP22-211	ENST00000584538	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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