RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.44□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CDH9Q9ULB4 789 aa6.44□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.44□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GINS2Q9Y248 185 aa6.44□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.44□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.44□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.44□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 C22orf46C9J442 243 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 E7ENQ6 273 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CYB561D2O14569 222 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DCLK1O15075 740 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MFSD11O43934 449 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GLRA3O75311 464 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 F9P00740 461 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CAPNS1P04632 268 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MYL3P08590 195 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CCND1P24385 295 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 AKAP5P24588 427 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PCSK1P29120 753 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CYP2C18P33260 490 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CRHR1P34998 444 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SERPINB6P35237 376 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NKX3-2P78367 333 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GBE1Q04446 702 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DEUP1Q05D60 604 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DPYSQ14117 519 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TBCCQ15814 346 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 INSCQ1MX18 579 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 RAB6CQ53S08 254 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 RAB41Q5JT25 222 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ZNF534Q76KX8 674 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FAM228AQ86W67 206 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 OSTM1Q86WC4 334 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DEFB106AQ8N104 65 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CCDC185Q8N715 623 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PPM1NQ8N819 430 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ATP2A3Q93084 1043 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 C1orf159Q96HA4 380 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SERAC1Q96JX3 654 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 VAT1Q99536 393 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PTPN18Q99952 460 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SYT15Q9BQS2 421 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 APOL6Q9BWW8 343 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DSEQ9UL01 958 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CHKBQ9Y259 395 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PLLPQ9Y342 182 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 HES2Q9Y543 173 aa6.43□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 M0QYT0 321 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 RNF103O00237 685 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PTGESO14684 152 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PSMD3O43242 534 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 HAUS5O94927 633 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 METTL18O95568 372 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 THP07101 528 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PDGFRBP09619 1106 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ODC1P11926 461 aa6.42□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NEFHP12036 1026 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms