RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093		B2RBV5	119 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093		K7ENP7	123 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093		O00370	1275 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	IKBKB	O14920	756 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PIAS2	O75928	621 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	YEATS4	O95619	227 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CTSL	P07711	333 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CDK4	P11802	303 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CKMT1A	P12532	417 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CD19	P15391	556 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	C5AR1	P21730	350 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBX4	P57082	545 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF445	P59923	1031 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	AMPD3	Q01432	767 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	POU4F1	Q01851	419 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SERINC3	Q13530	473 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CUL2	Q13617	745 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CDH18	Q13634	790 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PKP1	Q13835	747 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	E2F5	Q15329	346 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	BROX	Q5VW32	411 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	KAT5	Q92993	513 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	MED8	Q96G25	268 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	WBP1	Q96G27	269 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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