RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 KCNA4P22459 653 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 CRABP2P29373 138 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 LIG3P49916 1009 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 POU4F1Q01851 419 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 CNSTQ6PJW8 725 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 RMDN1Q96DB5 314 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 THAP1Q9NVV9 213 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 CCL22O00626 93 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 AURKAO14965 403 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 DCTN3O75935 186 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 CRTAMO95727 393 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 PIRTP0C851 137 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 HOXA9P31269 272 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 CAMK1Q14012 370 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 APCDD1Q8J025 514 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 GPATCH11Q8N954 259 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 TBATAQ96M53 351 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 KCNK13Q9HB14 408 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 ACOT9Q9Y305 439 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-210ENST00000567949 MOSPD3O75425 235 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 APOA4P06727 396 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 IRS1P35568 1242 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 AVPR1AP37288 418 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 CLCN5P51795 746 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 RHOAP61586 193 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 SETDB1Q15047 1291 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 RETSATQ6NUM9 610 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 SPRED2Q7Z698 418 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 CEP97Q8IW35 865 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 FIBINQ8TAL6 211 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 OMDQ99983 421 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 PLK2Q9NYY3 685 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.58■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 GRM6O15303 877 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 SERPINE1P05121 402 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 RB1P06400 928 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 PDHA1P08559 390 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 GRK2P25098 689 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 MAGEA9P43362 315 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 TAS2R39P59534 338 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 BNIP1Q12981 228 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 PTPRCAPQ14761 206 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 TEAD2Q15562 447 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 TNS4Q8IZW8 715 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 GPR150Q8NGU9 434 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 ACDQ96AP0 544 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 LRRC37BQ96QE4 947 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 TASP1Q9H6P5 420 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 MID2Q9UJV3 735 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 A0A0G2JND7 137 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 OR51F1A6NGY5 319 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 G3V2L1 256 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 ARHGEF15O94989 841 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 GLP2RO95838 553 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 S1PR4O95977 384 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 MT-CO1P00395 513 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 RHOP08100 348 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 ARFIP2P53365 341 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 PGGT1BP53609 377 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 LMAN2Q12907 356 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 TRAF2Q12933 501 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU2-210ENST00000567949 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms